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高通量全自動樣品處理工作站

發(fā)布時間: 2017-05-19   瀏覽次數(shù) 2683 次

適用于全自動、中到高通量應(yīng)用,96孔板形式
?    從細胞、組織和血液中全自動純化RNA
?    從拭子、血液和法醫(yī)樣本中全自動純化DNA
?    從細菌中純化質(zhì)粒DNA
?    擴增反應(yīng)產(chǎn)物中DNA的回收
?    RT-PCR、PCR、測序反應(yīng)和法醫(yī)檢測反應(yīng)體系構(gòu)建

BioRobot Universal System整合了高通量應(yīng)用所需的所有儀器、軟件、純化技術(shù)和酶。Application Packs可用于基因表達、基因分型、測序、法醫(yī)、獸醫(yī)和藥物應(yīng)用。全自動的優(yōu)化方案可以純化高純度RNA、基因組DNA和質(zhì)粒DNA并進行PCR產(chǎn)物回收。自動化的RT-PCR、PCR、測序和法醫(yī)檢測反應(yīng)體系構(gòu)建具有高可靠性和標準化水平,并且有助于消除因操作錯誤,特別是處理大量樣品而產(chǎn)生的偏差。

原理
基因表達應(yīng)用
BioRobot Universal System配合Application Pack, Gene Expression使用,能夠?qū)ρ海ㄊ占赑AXgene Blood RNA Tubes中)、組織和細胞樣本進行96孔板RT-PCR反應(yīng)體系構(gòu)建和自動純化RNA。自動化的純化流程可從血液中純化高純度RNA具有高重復(fù)性。
BioRobot Universal System配合RNeasy 96 Universal Tissue 8000 Kit使用能夠從組織,包括裂解的脂肪和纖維組織中純化得到高品質(zhì)RNA。

應(yīng)用RNeasy 96 BioRobot 8000 Kit可從細胞中純化得到RNA。純化流程的可靠性和效率已經(jīng)過大范圍的起始板量的線性CT值驗證,線性范圍下至10個細胞,上至5 x 105個細胞。
基因分型應(yīng)用
BioRobot Universal System配合Application Pack, Genotyping使用,能夠從口腔拭子或者人類全血中自動純化基因組DNA??梢允褂萌詣臃桨笍闹炼?92個口腔拭子樣本或96個人類全血樣本中純化高品質(zhì)基因組DNA。自動化的純化流程能完全消除所有污染物和酶抑制劑,純化得到的DNA可以立即應(yīng)用于高通量的基因分型應(yīng)用中。CT值具有高度的可重復(fù)性,證明了該純化方案的效率和可靠性。
自動化的PCR反應(yīng)體系構(gòu)建確保較高可靠性和標準化,并有助于消除因操作失誤,特別是處理大量樣品時產(chǎn)生的偏差。BioRobot Universal System可獲得高度重復(fù)性的CT值,沒有可檢測到的交叉污染(參見下表)。


BioRobot Universal System上用自動化流程進行擴增反應(yīng)體系設(shè)置。96孔板中柱以交替次序包含不含RNAse的純水(13、5、7、911)或4 ng模板DNA24、68、1012)。用QuantiTect Probe PCR Kit,和專為β-肌動蛋白基因設(shè)計的引物和探針進行real-time PCR,獲得CT值表示。X:在35個循環(huán)后,檢測不到信號。

無可檢測到的交叉感染

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

X

26.1

X

26.0

X

26.2

X

25.9

X

25.8

X

25.6

B

X

26.2

X

26.4

X

26.1

X

26.2

X

25.9

X

26.0

C

X

26.2

X

26.1

X

26.3

X

25.9

X

26.1

X

26.2

D

X

26.5

X

26.4

X

26.1

X

26.0

X

26.2

X

26.4

E

X

26.3

X

26.3

X

25.8

X

26.3

X

26.0

X

26.2

F

X

26.1

X

26.1

X

26.3

X

26.3

X

25.8

X

25.9

G

X

26.5

X

25.9

X

26.5

X

25.8

X

26.0

X

26.3

H

X

26.2

X

26.0

X

26.3

X

25.8

X

26.0

X

25.7


測序
BioRobot Universal System配合Application Pack, Sequencing使用,能夠自動純化質(zhì)粒DNA、回收DNA和進行測序反應(yīng)體系構(gòu)建。使用QIAprep 96 Turbo BioRobot Kit,每次可從至多4 x 96個E. coli培養(yǎng)物(1–5 ml)中純化得到分子生物學(xué)檢測級別的質(zhì)粒DNA 。DNA產(chǎn)量具有高度重復(fù)性。
使用MinElute 96 UF PCR Purification Kit的全自動化方案每次可以從至多4 x 96個樣本中純化得到PCR產(chǎn)物(>100 bp)。PCR產(chǎn)物的回收率可與手動操作流程相當,證明了全自動方案的可靠性。


Investigator應(yīng)用
BioRobot Universal System配合Application Pack, Investigator使用,能夠純化法醫(yī)學(xué)樣本中的總DNA,包括干血、表面拭子(例如,血液、精液、唾液和上皮細胞等)、面料上的污漬(例如,血液或者唾液污染的面料等)、煙頭、煙草、口香糖和信封。
使用經(jīng)驗證的QIAamp 96技術(shù)可進行高效純化,并且純化得到的DNA在敏感下游應(yīng)用中表現(xiàn)良好,如STR分析具有高命中率。強大的純化程序使用QIAamp 96 DNA Swab BioRobot Kit,確保過程中的安全性,并有助于防止交叉污染。

Principle
BioRobot Universal System提供從不同類型樣本中純化高品質(zhì)核酸的全自動純化方案。此外,該儀器以96孔板形式進行下游反應(yīng)設(shè)置。通過自動化純化核酸和反應(yīng)體系構(gòu)建,BioRobot Universal System節(jié)省了手動操作時間,并且確保了高效、精簡的工作流程。
每個Application Pack都提供純化和下游反應(yīng)體系構(gòu)建。有4種Application Packs可用:
Application Pack, Gene Expression
Application Pack, Genotyping
Application Pack, Sequencing
Application Pack, Investigator

流程
BioRobot Universal System的自動化純化為簡單的結(jié)合、洗滌、洗脫過程。用戶選擇純化實驗方案,然后根據(jù)軟件指導(dǎo)的信息完成所需的余下步驟來設(shè)置儀器。每次純化的樣本數(shù)量取決于樣本類型和純化的分析物(參見下表)。


樣本通量/樣本類型

應(yīng)用

每次純化的樣本

下游反應(yīng)體系構(gòu)建

血液(收集在PAXgene Blood
RNA Tubes
中)

RNA純化

48或者96個樣本

real-time RT-PCR;cRNA制備

細胞

RNA純化

96的倍數(shù),至多192個樣本

real-time RT-PCRcRNA制備

組織

RNA純化

8的倍數(shù),24–96個樣本

real-time RT-PCRcRNA制備

口腔拭子

基因組DNA純化

8的倍數(shù),至多192個樣本

real-time PCRQuantifiler分析、
AmpFISTR Identifiler
分析、
AmpFISTR SGM plus
分析、 Picogreen 分析

血液

基因組DNA純化

8的倍數(shù),32–96個樣本

real-time PCR

法醫(yī)學(xué)樣本

基因組DNA純化

8的倍數(shù),24–96個樣本

Quantifiler分析、
AmpFISTR Identifiler
分析、
AmpFISTR SGM plus
分析、Picogreen分析

E. coli培養(yǎng)物

質(zhì)粒DNA純化

32–384個樣本(32倍數(shù)中32–96個樣本;96倍數(shù)中96–384個樣本)

測序反應(yīng)體系構(gòu)建

擴增反應(yīng)

DNA產(chǎn)物回收

8–384個樣本(8倍數(shù)中8–96 個樣本;96倍數(shù)中 96–384個樣本)


有專為病毒核酸純化設(shè)計的實驗方案,如痰、血漿、呼吸道樣本和培養(yǎng)基中的細菌DNA;請聯(lián)系QIAGEN Technical Services或當?shù)氐匿N售代表以獲得更多信息。
應(yīng)用
BioRobot Universal System適用于以96孔板形式進行中到高通量的實驗室應(yīng)用,如:
?    基因表達分析
?    基因分型研究
?    測序
?    法醫(yī)應(yīng)用

軟件
QIAsoft 5是BioRobot Universal System的控制系統(tǒng),提供簡單的系統(tǒng)操作和可重復(fù)的樣本處理。詳細的上樣檢查,確保樣本、試劑和實驗室器具正確安裝,在工作臺設(shè)置過程中,有助于避免人為失誤。QIAsoft 5提供便捷的用戶管理,并可使用Checksum校驗不恰當?shù)男薷囊员Wo報告與結(jié)果文檔。
QIAsoft 5同樣也滿足用戶對21 CFR Part 11的技術(shù)需求。此外,由QIAsoft 5使用或者生成的文件能夠用于實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)進行便捷的數(shù)據(jù)管理與兼容。QIAsoft 5內(nèi)的電子表格功能為制定的應(yīng)用提供便捷的移液方案。